Alcaraz s-a retras din competiție după ce a pierdut în fața lui Daniil Medvedev în semifinalele US Open, spunând că are nevoie de odihnă.
Spania ar fi avut nevoie de numărul doi mondial după ce a pierdut miercuri, la Valencia, meciul de deschidere din Grupa C, 3-0 în fața Cehiei.
Djokovic, a cărui echipă din Serbia înfruntă vineri Spania, a declarat presei spaniole la Valencia: "Poate că voi sunteți supărați că nu joacă pentru Spania, pentru că el are 20 de ani și eu am 36, și cum de el este obosit și eu nu sunt.
"Este important să înțelegeți că mai are mult timp în față".
Djokovic, care l-a învins pe Medvedev pentru un record de 24 de Grand Slam la Flushing Meadows, a adăugat: " A jucat deja pentru Spania anul trecut, nu poți uita asta.
"A câștigat US Open anul trecut, iar după câteva zile era aici, jucând cu inima și pasiune pentru țara sa."
Numărul unu mondial și-a amintit supărarea pe care a declanșat-o atunci când a ales să nu concureze pentru Serbia în competiția anuală masculină pe echipe.
"Am chiulit de câteva ori de la Cupa Davis, știu că și reacția din partea țării mele nu a fost atât de mare și există multă negativitate atunci când nu joci pentru țara ta", a spus el.
"Este dificil să fii mereu perfect și mereu disponibil. Facem parte dintr-un sport individual, îți reprezinți țara, dar și pe tine însuți și sunt multe turnee, iar el a jucat mult".
Djokovic a adăugat: " Chiar dacă are 20 de ani, asta nu înseamnă că este un Superman.
"Trebuie să se odihnească și el ... Este mai bine pentru noi, pentru echipa sârbă, că nu este aici, sincer, dar sunt sigur că se va întoarce și va aduce multă bucurie Spaniei."
Djokovic a fost odihnit de căpitanul Serbiei în Cupa Davis, Viktor Troicki, pentru meciul de deschidere al țării sale, câștigat marți cu 3-0 în fața Coreei de Sud.
Dar, în ciuda unui sezon lung, el a declarat că este pregătit să ajute Serbia în încercarea de a se califica în finala eliminatorie de la Malaga, luna viitoare.
"Nu mă simt foarte proaspăt, evident, după câteva luni obositoare, cu multe meciuri, dar cred că este o oboseală pozitivă pentru succesul pe care l-am avut în America.
"Nu este prea mult timp pentru a recupera, trebuie să încerc să mențin intensitatea și să fac tot ce pot pentru a-mi adapta corpul și pe mine la noul fus orar și la noile condiții și să contribui la țara mea cu puncte."