Chelsea l-a transferat pe Nkunku de la germanii de la RB Leipzig pentru peste 50 de milioane de lire sterline în finalul sezonului, dar internaționalul francez a ratat prima parte a campaniei din cauza unei accidentări grave la genunchi.
Nkunku și-a făcut prima apariție pentru Chelsea pe 19 decembrie, dar a suferit ceea ce Pochettino descrisese anterior ca fiind o problemă minoră la șold împotriva lui Luton Town pe 30 decembrie și a ratat înfrângerea lui Chelsea din Cupa Ligii cu 1-0 la Middlesbrough la mijlocul săptămânii.
Se aștepta ca el să revină în echipă pentru meciul de sâmbătă din Premier League de pe teren propriu cu Fulham, dar Pochettino a declarat la o conferință de presă că nu mai este sigur când va juca din nou Nkunku.
"Mă îngrijorează situația lui Nkunku", a spus Pochettino. "Cred că acum (au trecut) 10 zile de când nu se poate antrena. Îl evaluăm. Nu știm ce se va întâmpla.
"A fost o mică problemă și (s-a) complicat. Suntem dezamăgiți pentru că vrem ca el să fie implicat din nou cât mai curând posibil".
Au existat vești mai bune din alte direcții, fundașii Ben Chilwell (27) și Benoit Badiashile (22) și mijlocașul Carney Chukwuemeka (20), fiind disponibili pentru meciul de sâmbătă după ce au lipsit din cauza unor accidentări.
Pochettino a declarat că jucătorii săi au un moral bun în ciuda înfrângerii cu Middlesbrough în prima manșă a semifinalei Cupei Ligii și că tânăra sa echipă a avut tăria de caracter pentru a accepta criticile venite în direcția lor.
"I-am văzut pe jucători astăzi și erau foarte bine dispuși", a spus el. "Bineînțeles că sunt dezamăgiți de ultimul meci, dar acelea au fost primele 90 de minute. În 10 sau 12 zile vom juca a doua rundă.
"Uneori putem învăța din critici și din faptul că suntem duri".
Chelsea se află pe locul 10 în clasament, dar se îndreaptă spre meciul cu Fulham după ce a câștigat două meciuri consecutive în campionat pentru a doua oară în acest sezon.
O victorie ar putea să o catapulteze pe Chelsea peste locul opt, Manchester United, dar Pochettino a spus că nu se gândește prea mult la clasament.
"Pentru noi, este vorba de a performa și de a câștiga. Cred că în acest moment nu este important să fim pe o poziție", a spus el.
"Fiecare meci ar trebui să fie o prioritate pentru noi. Trebuie să jucăm fiecare meci ca pe o finală.
"Cel mai dificil lucru este să fim constanți, pentru că suntem o echipă tânără. Dar trebuie să încercăm".