Antrenorul de 68 de ani avea contract până în 2024. El părăsește funcția cu singurele două reușite ale Portugaliei în fotbalul de seniori: Campionatul European din 2016 și Liga Națiunilor 2019.
Fernando Santos a ajuns la naționala Portugaliei în anul 2014, ca înlocuitor al lui Paulo Bento.
În 2016, el a condus naționala la o victorie în fața Franței (1-0 d.p.), asigurându-le câștigarea Campionatului European. Trei ani mai târziu, un gol marcat de Gonçalo Guedes împotriva Olandei (1-0) a fost suficient pentru ca Portugalia să devină prima câștigătoare a Ligii Națiunilor.
De asemenea, a condus Portugalia la Cupa Confederațiilor 2017 (înfrângerea în finala mică în fața Mexicului), la Cupa Mondială-2018 (eliminare în optimile de finală împotriva Uruguayului) și la Euro-2020 (înfrângere în fața Belgiei în optimile de finală) înainte de această Cupă Mondială.
În cele 109 meciuri ca și selecționer a înregistrat 67 de victorii, 23 de remize și 19 înfrângeri.
În timpul mandatului său, Fernando Santos a acordat prima convocare la 59 de jucători, printre care se numără nume precum Bernardo Silva, Danilo Pereira, Rúben Neves, Renato Sanches, João Cancelo, Bruno Fernandes, Rúben Dias, João Félix sau Diogo Jota. Cei mai recenți au fost António Silva și Gonçalo Ramos, ambii convocați pentru Cupa Mondială 2022 din Qatar.
"Mulțumesc echipei mele tehnice, Federației Portugeheze, lui Humberto Coelho, João Pinto, mereu alături de mine și întregului personal care a lucrat cu mine în ultimii ani, dar și tuturor celor care s-au intersectat cu mine în Federație. Vor rămâne pentru totdeauna în inima mea. Mulțumesc, într-un mod deosebit, domnului doctor Fernando Gomes, care m-a susținut mereu și a fost ceea ce ar trebui să fie un lider în vremurile bune și mai ales în cele mai grele momente ”, a declarat Santos.
Fostul selecționer a transmis un mesaj și pentru suporterii portughezi.
„Un ultim cuvânt pentru suporterii portughezi, de acum încolo voi fi unul dintre multele milioane care aplaudă și susțin echipa națională. Voi fi trup și suflet, ca întotdeauna, nu pe teren, ci în tribune și oriunde voi fi. Vom cânta imnul împreună și ne vom dori ca echipa noastră a tuturor să ne ofere multe bucurii," a mai precizat Fernando Santos.