El a luptat pentru a salva două mingi de meci într-o partidă epică de cinci seturi împotriva brazilianului Thiago Monteiro pe John Cain Arena.
Nishikori, care a ajuns pe locul patru în lume în carieră și a fost finalist la US Open în urmă cu un deceniu, s-a mobilizat pentru a câștiga 4-6, 6-7(4), 7-5, 6-2, 6-3 în 4 ore și 6 minute.
"Aproape că am renunțat la mingea de meci", a spus Nishikori, care se află pe drumul revenirii după ce a petrecut ani de zile pe tușă din cauza unei operații majore la șold și a unei accidentări la gleznă.
"Juca foarte bine și era pe val. Dar cumva am luptat până la capăt.
"A fost foarte greu", a adăugat el. "Am încercat să rămân calm, chiar dacă eram aproape eliminat din turneu. Am încercat să lupt până la sfârșit".
După chinurile sale legate de accidentări, Nishikori a revenit pentru a disputa primele sale două Grand Slam-uri anul trecut, ajungând în turul al doilea la Roland Garros înainte de a se retrage cu o problemă la umăr.
El și-a revenit pentru a juca la Wimbledon, pierzând în primul tur, dar a recunoscut că a fost aproape să renunțe.
"Mă gândeam că, dacă mai am încă o operație, atunci cred că mental nu mai sunt capabil să lupt".
Dar a adăugat că încă îi place să concureze.
"Am vrut să joc (din nou) pe o arenă mare ca astăzi", a spus el.
"Acesta a fost obiectivul meu acum un an, când făceam reabilitare. Încă mai cred că am șansa de a juca cu acești jucători de top."
Antrenat de campionul din 2002 de la Australian Open, Thomas Johansson, el va juca în continuare fie cu americanul Tommy Paul, cap de serie numărul 12, fie cu australianul Chris O'Connell.