Perez a plecat de pe locul 18 și a terminat pe ultimul loc după ce a primit o penalizare pentru un start fals și apoi a fost implicat în mai multe ciocniri cu alți piloți care i-au lăsat mașina avariată.
În același timp, Red Bull a pierdut locul doi în clasamentul constructorilor în favoarea Ferrari, în ciuda faptului că Max Verstappen conduce campionatul piloților.
Întrebat direct dacă Perez - a cărui formă s-a prăbușit din luna mai - va termina sezonul cu Red Bull, Horner nu a oferit cuvinte de consolare pentru un pilot care, tehnic, are un contract pentru 2025.
În schimb, a sunat ca și cum Perez ar fi alergat pentru ultima dată în fața publicului său de acasă în F1.
"Știți, vine un moment în care trebuie luate decizii dificile", a spus Horner. "Suntem acum pe locul trei în campionatul constructorilor.
"Determinarea noastră este să încercăm să revenim într-o poziție câștigătoare, dar va fi o sarcină dificilă în următoarele patru curse".
Horner a spus că Perez va fi în Brazilia weekendul viitor, dar au existat multe speculații pe Autodromo Hermanos Rodriguez că ar putea fi făcută o schimbare pentru ultimele trei runde.
Horner a declarat că weekendul lui Perez a fost "oribil", fără ca nimic să meargă bine pentru el.
"El știe că Formula 1 este o afacere bazată pe rezultate și, în mod inevitabil, atunci când nu reușești să dai randament, lumina reflectoarelor este fixată pe tine".
Horner a repetat declarația când a fost întrebat dacă scaunul lui Perez era în pericol, referindu-se la mexican ca fiind "neperformant" și spunând că examinarea a fost constantă.
"Ca echipă, avem nevoie ca ambele mașini să obțină puncte și asta este natura Formulei 1", a adăugat el.
"Lucrăm cu el cât de mult putem pentru a încerca să îl susținem. Cred că am făcut tot ce am putut pentru a-l sprijini pe Checo și vom continua să facem acest lucru în Brazilia weekendul viitor.
"Dar vine un moment în care nu poți face mai mult."