Lovitura de cap uimitoare a lui Ilkay Gundogan și penalty-ul lui Erling Haaland din repriza a doua au adus City pe locul trei în Premier League în ultima etapă a sezonului.
Cu toate acestea, Grealish, semnătura record a clubului, nu s-a deplasat la Craven Cottage pentru o partidă pe care Guardiola a catalogat-o drept cea mai importantă din campania lui City.
Absența starului englez a ridicat noi semne de întrebare cu privire la viitorul său, după un sezon petrecut mai ales pe bancă.
Iar Guardiola a recunoscut că Grealish nu este sigur că va fi la City când va începe sezonul viitor.
"A fost selecția", a spus Guardiola. "El este un jucător incredibil care trebuie să joace fotbal la fiecare trei zile. Nu s-a întâmplat în acest sezon și nici în sezonul trecut.
"Trebuie să o facă, și asta este cu noi sau în alt loc. Și asta e o întrebare pentru Jack, agentul său și club.
"Dacă rămâne, va fi bine și el a luptat așa cum a luptat din prima zi pentru a aduce o contribuție, dar nu astăzi".
Grealish, 29, a semnat de la Aston Villa în 2021 pentru 100 de milioane de lire sterline și a jucat un rol cheie în asigurarea de către City a Premier League, Liga Campionilor și Cupa FA tripla istorică din 2023.
Cu toate acestea, el a început doar de șapte ori în campionat în acest sezon și a fost un înlocuitor neutilizat în înfrângerea lui City în finala Cupei FA la Crystal Palace.
"Nu este ceva personal”
Pune la Guardiola că el este nefericit cu Grealish, spaniolul a ripostat: "Cine a spus că nu sunt mulțumit de Jack? Rico (Lewis) nu a fost selectat, (James) McAtee a fost excepțional împotriva Aston Villa și Wolves. De ce nu mă întrebați despre McAtee?
"Nu este personal. Am 24 de jucători, trebuie să scap de șase jucători pentru ultimul meci și cinci astăzi pentru că (Mateo) Kovacic a fost eliminat.
"Eu sunt persoana care a luptat pentru Jack să vină aici și persoana care a luptat pentru el să rămână aici în acest sezon și în sezonul următor.
"Eu sunt cel care a spus: "Îl vreau pe Jack Grealish". Ce se întâmplă în viitor este o treabă pentru (directorii de fotbal) Txiki (Begiristain), Hugo (Viana) și agenții."
City a început sezonul cu gâdul de a câștiga al cincilea titlu consecutiv, dar a terminat fără niciun trofeu pentru prima dată în opt ani.
În cele din urmă, Guardiola a fost fericit să încheie o campanie păguboasă prin asigurarea unui loc lucrativ în Liga Campionilor.
"Este o ușurare, pentru că astăzi calificarea în Liga Campionilor este ca și cum ai câștiga titlul", a spus el.
"Când nu am putut câștiga Premier League, jucătorii ar fi putut spune: "Nu mai lupt". Asta s-a întâmplat în această țară de foarte multe ori, când câștigătorul Premier League nu s-a calificat în Liga Campionilor.
"Nu am renunțat niciodată. Oamenii nu vor crede asta, dar este o zi foarte fericită pentru noi".
Promițând că City va reveni mai puternică în sezonul următor, Guardiola a spus: "vom învăța lecțiile și sezonul viitor nu se va întâmpla din nou. Vom fi mai buni".