City a condus de două ori pe Etihad, Erling Haaland marcând în sfârșit pentru prima oară împotriva giganților spanioli.
Dar golurile norvegianului nu pot acoperi fisurile evidente ale lui City din acest sezon.
Brahim Diaz a marcat împotriva fostului său club la doar câteva secunde după ce a venit de pe bancă, înainte ca Jude Bellingham, la întoarcerea sa în Anglia, să înscrie golul victoriei în prelungiri, după o altă calamitate defensivă a lui City.
City a primit acum opt goluri în ultimele 15 minute ale ultimelor cinci meciuri din Liga Campionilor.
Marea problemă a oamenilor lui Pep sunt golurile din ultimele minute mai ales în Premier League, unde City se află la 15 puncte în spatele liderului Liverpool.
În ciuda faptului că a câștigat doar trei din cele opt meciuri anterioare în faza de campionat a Ligii Campionilor, City s-a strecurat în play-off în ultima seară a fazei de campionat.
Cu toate acestea, ei au plătit prețul terminării pe locul 22 în clasamentul celor 36 de echipe calificate, fiind împerecheați cu marii rivali spanioli.
Cluburile se înfruntă pentru al patrulea sezon consecutiv în Liga Campionilor.
Madridul s-a impus în două dintre cele trei confruntări anterioare, dar, de fiecare dată, deplasarea pe Etihad a fost una dureroasă.
În 2022 și 2023, oamenii lui Carlo Ancelotti au încasat patru goluri, în timp ce anul trecut s-au agățat curajos de o remiză 1-1 înainte de a evolua la penalty-uri.
De data aceasta a fost o poveste diferită, cu mult înainte de răsturnarea de situație târzie din poveste.
"A fost un meci ciudat. Am jucat o parte din cel mai bun fotbal al nostru din acest sezon și am sfârșit în urmă", a spus Bellingham.
City îmbătrânește
Madridul ar fi putut înscrie de trei ori în primele 15 minute prin Vinicius Junior, Kylian Mbappe și Ferland Mendy.
O serie de alte ocazii au apărut și au dispărut înainte ca Mbappe să anuleze deschiderea de scor a lui Haaland cu o greșeală norocoasă.
Haaland a readus City în avantaj din penalty cu 10 minute înainte de final.
"Adevărul este că nu suntem suficient de stabili. S-a întâmplat de multe ori", a recunoscut Guardiola.
"În cele din urmă la acest nivel este atât de dificil. Nu este prima dată".
Prima înfrângere europeană acasă a lui City din 2018 a agravat cel mai dificil sezon din strălucitoarea carieră de antrenor a lui Guardiola până în prezent.